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首先要说的是，不建议养折耳猫主要是因为折耳猫是一种本身就有基因缺陷的动物。折耳猫的折耳性状是由基因突变导致的，这一基因会影响猫咪的软骨发育；几乎所有折耳猫都存在不同程度的骨骼发育异常，随着年龄增长，它们可能会逐渐出现关节肿大、疼痛、僵硬，导致行动不便，甚至可能出现跛行。这个病一旦发作是不能够进行治愈的，一些病情严重的折耳猫会因为疼痛而无法正常活动。
除了骨骼问题，折耳猫还容易患上呼吸系统疾病、心血管疾病以及眼部疾病等。由于骨骼发育异常可能影响胸廓的正常结构，进而压迫肺部，导致呼吸不畅；折耳猫的心脏也可能因为身体结构的改变而承受额外的负担，增加患心血管疾病的风险；折耳猫还容易出现结膜炎、角膜炎等眼部炎症，影响视力。每一只折耳猫的出生，都是对这种遗传病痛的延续，即使与立耳猫配种，后代也可能携带并传递这一基因缺陷。从伦理角度考虑，继续繁殖折耳猫意味着不断制造痛苦的生命，兽医和动物福利组织普遍不推荐饲养折耳猫。
